Беглов объявил о своем уходе из министерства здравоохранения 6 июня 2025 года. Уже на следующий день его задержали по статьям 91 и 92 УПК РФ, а 10 июня арестовали по подозрению в коррупции до 7 августа. 23 июня Кемеровский областной суд рассмотрел апелляционную жалобу адвоката, защищавшего интересы Дмитрия Беглова, но оставил ее без удовлетворения.

По версии следствия, в период с января по июнь 2025 года обвиняемый, действуя умышленно и из корыстных побуждений, с целью получения взятки в крупном и особо крупном размере, лично получил денежные средства от индивидуального предпринимателя и юридических лиц. Вознаграждение передавалось за содействие в заключении договоров на закупку и поставку медицинских изделий и товаров медицинского назначения, а также за общее покровительство в служебной деятельности.

Экс-чиновник обвиняется в совершении преступлений, предусмотренных пунктом «в» части 5 статьи 290, частью 6 статьи 290 и частью 6 статьи 290 УК РФ. Постановление суда пока не вступило в законную силу.